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在骨组织研究领域，Micro CT可以很好地研究骨结构和骨密度的数量性指标及微细改变，可指导组织工程、基因工程等科学研究，已逐渐发展为可加强甚至代替组织学分析的一种成熟的技术。骨质疏松是由于多种原因导致的骨密度和骨质量下降，骨微结构破坏，造成骨脆性增加，从而容易发生骨折的全身性骨病。为更好地分析骨质疏松产生的原因，研究治1疗骨质疏松的方法，研究者们通常使用小动物模型来进行药1物疗1效和病理的相关研究。

种子内部的形态学信息参数，以及胚芽和胚乳区域的瑕疵率等，是评估种子的出芽率和质量的关键信息。传统方法常采用内窥镜来分析种子内部的形态，然而这种方法只能获得有限的投影，受种子放置方位的影响，很多缺陷无法体现。

而Micro CT通过投影重建、三维成像功能，可提供种子的不同角度的观察，对于种子内部结构展现更加全1面，例如裂隙、内部萌芽情况评估、病虫害情况等等。

肺是呼吸系统的主要器1官，除了主管呼吸功能以外还具备非呼吸性的防御、免1疫及内1分泌代谢功能等。肺对于我们人类来说至关重要，因此肺部发生的疾病也严重威胁着人类健康。由于充气肺与软组织之间的高对比度，CT 成像可以以高空间和时间分辨率提供详细的结构信息，因此比其他方法更适合用于肺部疾病模型的监测。Micro-CT 也即小动物 CT，是临床探究肺部疾病的重要影像学工具