微耕机平常使用中要注意不要堵塞活塞，造成环沟不畅通，无法的燃烧机油，损伤发动机。要了解机器的构造、性能、如何使用等等，只有对微耕机有一定的了解，才能在使用中得心应手。微耕机在使用中螺栓、螺母容易松动，还有微耕机各部位的调整螺栓都要仔细检查。微耕机机体小、重量轻，特别适合于大棚、果园等地使用。大棚用的微耕机机体小巧，工作起来，操作起来简单灵活。
操作系保养主要包括三个方面，变速手柄、转向把手、离合器操纵手柄，需要保持这三项操作的灵活度。此外也要经常检查离合器分离装置，使其保持正常，否则将影响使用安全。作业前应检查各紧固部位紧固情况，油水是否达到要求，各操作手柄是否灵活，在确认无误后方可作业。作业后要除外部泥土、杂草等赃物污染，机器应保管在干燥的地方，各作业机具进行防锈处理，做好与主机同处保管，以免丢失。
原来双驱动微耕机需要人通过控制阻力杆的深度来控制设备的使用。旋耕深度太深，设备会一直往下挖，深度太浅，设备会快速向前跑。在这种情况下，人们很难支持它！发现问题，一定要解决。很快人们不懈努力通关，在两轮驱动微耕机的基础上发明了四轮驱动微耕机。与两轮驱动微耕机相比，四轮驱动微耕机有两个动力输出，一个是驱动行走轮，一个是工作。
旋耕机运转时有金属振动。造成这种现象的原因主要有：传动链过松后与传动箱接触擦擦；犁刀轴两侧的刀片、左支臂或传动箱变形后互相接触擦擦；刀片固定螺钉松动。排出方法：调整传动链的张紧度，纠正或更换严重变形的零件，松解螺丝。犁齿轮箱有杂音。由于在安装过程中有异物落到人，或轴承、齿轮齿损坏。解决办法：移除异物，更换轴承或齿轮。旋耕机不停地抛大块的土。其原因是：刀刃弯曲变形，刀刃断裂，丢失或磨损严重。解决方法：校正或更换刀片。