排水方式依据水量大小，土质情形，装备条件而定。水量不大，土质较好，一般采取简易排水法或吊桶排水；水量较大，土质较差，应采用水泵抽水。沉井小端一般都做成刀刃状的刃脚，以减少下沉阻力。刃脚应具有必定的强度，以免在下沉过程中破坏并漏水。刃脚的下端多做成有利于切入土中的情势。制作刃脚的资料，一般采用钢筋混凝土。刃脚是沉井受力集中的部分，必须有足够的强度，以免产生挠曲或损坏。当节井筒下沉至地面以上只剩1m左右时，应结束下沉，接长井筒。当沉井下沉至设计标高后，浇筑混凝土封底。为保证沉井能顺利下沉，沉井的重力必需大于或即是沉井外侧四周总摩阻力的1.15～1.25倍。
沉井下沉是沉井施工中一道非常重要的工序，在挖土下沉过程中若控制不好，就会出现质量问题，所以在下沉过程中必须采取严格的质量控制措施，并对常遇到的问题进行原因分析，总结出相应的处理方法。沉井虽然具有这些优点，一旦在施工过程中稍有不慎或质量控制不好，都将会出现一系列质量问题，纠偏起来难度相当大，成本相当高，给工程的正常使用带来很大的影响。在开始阶段，要经常检查沉井的平面位置，在纵横方向都应作好标记，随时注意防止较大的倾斜。在中间阶段，可能会出现下沉困难的现象，但在上节井体接高后，下沉又会变得明显，且仍可能出现偏斜事故。
在软粘性土层中，对下沉系数不大的沉井，采取连续挖土，连续下沉，中间停歇时间不要过长。采用射水法即在井壁腔内的不同高度处对称预埋射水管，在井壁外侧留有喇叭口朝上方的射水嘴，遇下沉缓慢或停沉时，用高压水射水以减少井壁与土层之间的摩阻力。引起沉井偏斜的原因，可能是沉井在制作时，就出现歪斜或挖土出现不均匀或地层土质软硬不均匀或井外侧临时堆土不当或沉井底部的一部分遇到障碍物等，都会引起沉井偏斜。沉井倾斜如受地下水方向影响时，先挖背水方面的土，后挖迎水方向的土。沉井挖出的土方好及时外运，即使条件不允许，也应搬运至离井壁四周影响范围之外处，且四周均匀堆放。