微耕机起动时用力抬起离合器。这种操作容易使离合器总成及其传动部件产生过大的磨损，严重时可能导致农机熄火。所以起动时要慢一点松开离合器踏板，同时适当加大油门行驶。
长期用脚踩离合器踏板。离合器踏板在不平路面上行驶时，脚踩离合器踏板会使离合器处于半分离状态，加剧离合器摩擦片的磨损。柴油微耕机起动后或熄火前猛轰油门。内燃机压缩比大于机，突然增大或减小油门，易造成连杆、曲轴变形或断裂，增加气缸活塞积碳，加速运动件磨损。
禁止作业时，在地头转弯时，应将旋耕机抬起，使刀片离开地面，减少动力油门，以免损坏刀片。禁止急转弯，以免损坏相关部件。。回转、穿越田埂、移位等作业时，应将旋耕机抬升至高位置，并分开作业离合器，以免损坏机件。如果转移到更远的地方，用锁定装置把旋耕机固定好。一般而言，每一班工作结束后都要对当班人员进行维护，内容包括：检查连接螺栓的紧固情况；检查易损零件如、插销和开口销等是否缺损，如有损坏应及时更换；检查电源、变速器、传动箱、轴承是否缺油，如缺油应及时补充。
黑土的特征是：土粘，微耕机耕旋出的土呈块装。在用微耕机工作时，需要不时地清理刀刃，否则刀刃粘着土，不能翻地。
黑土较湿，建议在土壤的水份较少时候翻土。水份越多越粘车，翻了一段距离就需要清理刀片。每天翻两三亩地都很吃力。
微耕机开荒时，杂草面积大的地块，要先将杂草除掉。或者是刀坎，或者是火烧，把大草除掉，用微耕机开荒，翻耕。
微耕机工作范围有限，对土壤要求严格。泥土中的有机质越少，越容易翻土。其在旱田中的应用效果优于稻田。
用微耕机时，应注意土壤坚硬、沙质、硬度高的地方。可多次来回地耕耘，不能蛮干，蛮干的结果是微耕机刀刃磨损甚至断裂。