净化工程洁净室之建筑主体构造，一般是用钢筋或骨水泥，但无论是何种构造，必须满足如下之条件：(1)不会因温度变化与振动而发生裂痕。(2)不易产生微尘粒子，且很难附着粒子。(3)吸湿性小。(4)为了维持室内之湿度条件，热绝缘性要高。进入洁净区的空气，经过初效(又称粗效)、中效、三级过滤器过滤，使空气达到所要求的洁净级别。
净化工程的设计中的注意事项：划分和布置空调净化和排风系统，选择合理的空气净化通风设备。在水平流系统中，气流是从一面墙流向另一面墙。在垂直流系统中，气流是从吊顶流向地面。对要求洁净室的悬浮粒子浓度或微生物浓度更低的场合，就使用单向气流。大部分净化厂房尤其电子工业用的洁净厂房都有严格的恒温、恒湿的要求，不仅对厂房内的温、湿度有严格的要求，而且对温度和相对湿度的波动范围也有严格的要求。
净化工程空调机房宜在洁净室侧面空调机房的位置，其位置宜在洁净室的侧面，这不但可以节能，也有利于风道的布置，并使气流组织更加合理，同时，可以节省工程费用。净化车间的检测步骤，将净化车间受测房间的温度控制在设计温度范围内，并保持稳定。关闭并固定好房间围护结构大部分的门、传递窗、周门和气密阀等。净化厂房地面可采用环氧自流坪地坪或耐磨塑料地板，有防静电要求的，可选用防静电型。 送回风管道用热渡锌板制成，贴净化保温效果好的阻燃型PF发泡塑胶板。